Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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