Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx17Q9D0I4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms