Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms