Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms