Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Bud23Q9CY21 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Bud23Q9CY21 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Bud23Q9CY21 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Bud23Q9CY21 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Bud23Q9CY21 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Bud23Q9CY21 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bud23Q9CY21 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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