Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PmpcbQ9CXT8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms