Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc2Q9CX47 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms