Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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