Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms