Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smurf1Q9CUN6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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