Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms