Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpa3Q9CQ71 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms