Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Chmp3Q9CQ10 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp3Q9CQ10 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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