Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms