Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup155Q99P88 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup155Q99P88 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Nup155Q99P88 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms