Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh8Q99NA2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms