Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms