Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
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