Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpd3Q99LY2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms