Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3bp5lQ99LH9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Sh3bp5lQ99LH9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Sh3bp5lQ99LH9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp5lQ99LH9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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