Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms