Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ciao1Q99KN2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ciao1Q99KN2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ciao1Q99KN2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Ciao1Q99KN2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms