Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps4Q99KG7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms