Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxp3Q99JB6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms