Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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