Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl1Q99J56 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Derl1Q99J56 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms