Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smim11aQ99J19 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smim11aQ99J19 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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