Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spdl1Q923A2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms