Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms