Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Odf3Q920N1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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