Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms