Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms