Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms