Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms