Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms