Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIB5

Barhl2, BarH-like 2 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl2Q8VIB5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barhl2Q8VIB5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms