Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc115Q8VE99 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms