Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Smg8Q8VE18 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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