Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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