Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc58Q8R3Q6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms