Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cdc16Q8R349 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cdc16Q8R349 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cdc16Q8R349 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdc16Q8R349 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cdc16Q8R349 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cdc16Q8R349 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cdc16Q8R349 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cdc16Q8R349 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cdc16Q8R349 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cdc16Q8R349 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdc16Q8R349 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc16Q8R349 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms