Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps37bQ8R0J7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps37bQ8R0J7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms