Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hecw1Q8K4P8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms