Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot6Q8K3P5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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