Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms