Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl47Q8K2Y7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms