Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cd300eQ8K249 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms