Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms