Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms