Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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SbsnQ8CIT9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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SbsnQ8CIT9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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SbsnQ8CIT9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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SbsnQ8CIT9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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SbsnQ8CIT9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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SbsnQ8CIT9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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SbsnQ8CIT9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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SbsnQ8CIT9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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SbsnQ8CIT9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SbsnQ8CIT9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SbsnQ8CIT9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SbsnQ8CIT9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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SbsnQ8CIT9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SbsnQ8CIT9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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